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犒劳杨爱。十四年，朝廷从播州调拨了五千人前去征讨贵州的贼人女首领米鲁等。
正德二年(1507)，播州宣慰使杨斌晋升为四川按察使，仍掌理宣慰事务。按照原先的制度，土官有功劳，朝廷给他赏赐衣带，或用旗帜奖赏他的部众，没有升官衔的。杨斌狡猾专横，不受两司的节制，唆使安抚罗忠等人上报他平定普安的战功，用重礼贿赂刘瑾，终于得以升职。过了一年，巡按御史俞缁说不应该授予杨斌四川按察使的官衔，便将他裁了，让他仍任原职。
早先，杨友既已被迁到保宁受管制，杨爱就更加恣意妄行，用从百姓中收刮来的财物贿赂中央的贵族，然后出兵夺取杨友以往的居住地凯里。同知杨才居住在安宁，乘此机会压迫剥削百姓比以往更甚，苗人很怨愤。凯里的百姓替杨友上奏要求恢复杨友的官职，不得，便潜入保宁，将杨友抢了回来，然后纠集众人作乱，攻打播州，焚烧了杨爱的居所和公私官邸，杀了杨才，还残戮了许多其他人。杨爱为此屡次上奏朝廷，皇帝命令镇巡官调拨军队前去征讨。此时杨友死了，于是军队便缓出。不久镇巡官说：“杨友的儿子杨弘能够悔过自新，而且善于招抚驾驭百姓，蛮族群众愿意听从他的号令约束。以前被杨友所焚烧杀害的，都已随当地习俗折价赔偿，同时还归还以前侵夺的东西给官府。我们请求朝廷授予杨弘冠带，封他为土舍，让他协同播州经历司招抚各族。他的家属已迁移安置到保宁的，允许他们回凯里，仍隶属于播州，受播州管辖。并谕告杨斌和杨弘通和，不得再制造争端。”该提议上报朝廷后，朝廷同意了。不久，播州安抚宋淮上奏说“：贵州凯口烂土的苗族人与凯里草塘诸寨子里的番族人结婚，暗地里相互勾结，诱使山里的苗人作乱。请求朝廷给杨斌颁敕谕，令他每年巡视边境，会同湖广镇巡官一起安抚处置。”兵部讨论认为土官中向来没有带着皇帝的敕谕出巡的，便谕告杨斌应安抚妥当当地的百姓，与亲族和睦相处，不辜负朝廷对他的优待。接着给已辞官在家的宣慰杨爱授昭毅将军的称号，皇帝给他颁布授官的诏令，赏赐绣有麒麟的衣服。这时杨斌又出面替他父亲请求晋升官阶和服装的颜色，礼科驳回他的请求，认为服装的颜色是等级威仪的象征，不能掺假。兵部则认为杨爱以前剿贼有功，答应了杨斌为其父亲所提的请求。杨斌又请求让其儿子杨相进国子监学习，得到朝廷的同意并得到皇帝所赐的冠带。
十二年(1517)，播州安抚罗忠、宋淮等人给朝廷上奏：“杨斌有父丧在身，想援引朝廷文官的例制替父亲守孝，但边关防务很重，请求朝廷让他在父丧期间仍掌管官印处理事务。”原初，杨弘回归凯里，与重安的土舍冯纶等人有怨。杨弘死后，冯纶诱使苗族人进攻凯里，这样双方便构怨仇杀，其祸害超出了贵州边境。巡抚邹文盛向朝廷描述了相互仇杀的状况，请求朝廷移文到四川，让贵州、四川的官员会同一起去招抚处理此事。该请求过了一年没有消息。邹文盛便派遣参议蔡潮进入播州，督促已辞官在家的杨斌出面安抚平定这场仇杀。因此邹文盛又上奏说：“应该恢复安宁宣抚，让杨弘的子弟承袭这个官位。杨斌还未衰老，应该再起用他，让他节制各蛮族人居住的寨子。蔡潮有招抚蛮族的功劳，应根据其功劳提升他的官职。”兵部讨论说“：安宁宣抚已经革除了就不能再恢复了，杨斌的儿子既然已经代理了其父的职务，杨斌自然也不能再起用了。土官是否应该继承原有官职，属于四川的事，不能由贵州说了算。邹文盛的请求难以施行，但其功劳不能抹杀。”十六年，朝廷赏赐给杨斌绣有蟒纹的衣服和玉腰带。
嘉靖元年(1522)，皇帝听从宣慰杨相的奏章，给播州儒学赏赐了四书集注。杨弘已经死了，他的弟弟杨张请求继承杨弘的职务，不得，便时常在边疆地区抢劫，抢走了白泥司的印信，又与杨相构兵为仇。当地守卫大臣请求朝廷将凯里改为隶属于贵州，以杨张为土知州。兵部讨论说：“杨张学得了其父兄的恶习，幸免于被杀；现在竟敢公开抢夺印信来要挟朝廷，应当命令四川、贵州的守卫大臣按其以前和最近所犯的争夺财产、杀人等罪状，按理处置。要是杨张能够向朝廷表示悔过，归还其所获的印信，尚可按情况授予他一个官职，让他听从朝廷的调遣去杀贼立功，赎自己的罪。要是他坚持作恶到底，必杀他以为那些玩弄法律者戒。”后来，答应让杨张继承宣抚官职，将安宁改为凯里，隶属于贵州。
当初，杨相的祖辈都是因为庶子与嫡子之间的争端，遗祸几世。到杨相时，他又宠爱庶子杨煦。杨相嫡子杨烈的母亲张氏，为人剽悍，与杨烈一起带兵赶走了杨相。杨相逃跑后，死在水西。杨烈到水西去索回父亲的尸体时，宣慰安万铨就要挟杨烈，要他将水烟、天旺两个地方归还给安万铨，然后再还尸体给杨烈。杨烈表面上答应了。等杨相的尸体归丧以后，杨烈吝惜土地坚决不给安万铨，于是便与水西方面结仇，还杀死水西的长官王黻。这是嘉靖二十三年(1544)的事。
杨烈继承父亲的官职之后，便与王黻的党徒李保带兵互相攻击，时间延续近十年。总督冯岳调拨总兵石邦宪将他们讨伐平定。真州的苗族人卢阿项也长期作乱，石邦宪用七千军队将其击败。有传言说贼人已向播州求援，石邦宪说：“我刚调遣水西的军队，说杨烈有帮助叛逆的罪行，杨烈还有功夫去救别人吗？”不久，石邦宪生擒了卢阿项父子，斩杀和俘获敌人四百多。原先，在嘉靖初年时，朝廷商议将凯里分出来，让其隶属于贵州。后来，又因为播州的土地大多都在贵州境内，就将凯里改成隶属于思石兵备。真州的盗贼被扫平以后，地方安宁了，播州人认为将凯里划归思石兵备很不方便。四川、贵州的守卫大臣也因意见不同无法决定，朝廷便命令总督合同两地的大臣前去审核。总督便向朝廷上奏，说仍将播州归四川管辖，而让贵州的思石兵备仍兼管播州、酉阳、黄平、邑州等地的土司事务。皇帝同意这种安排。
隆庆五年(1571)，杨烈死，其儿子杨应龙请求继承父亲的官职，朝廷同意了。万历元年(1573)，皇帝下诏书任命杨应龙为宣慰使。八年，皇帝同意杨应龙的请求，赐已故宣慰杨烈祭葬仪式。十四年，杨应龙向朝廷进献大木七十根，木材非常好，皇帝给他赏赐绣有飞鱼的衣服。杨应龙又援引其祖先杨斌的例子，希望朝廷赏赐他绣有蟒纹的衣服。礼部讨论，认为杨斌以前立有军功，又是出于边远地区，皇帝才特别恩赐，才赏蟒纹衣服，杨应龙不能比照杨斌的例子受赏。皇帝便命令给杨应龙授予都指挥使的官衔。
万历十八年(1590)，贵州巡抚叶梦熊上疏朝廷，谈了杨应龙为凶作恶的事情；巡按陈效也上疏一一诉说了杨应龙二十四条大罪状。此时正好是加强松潘的防卫，播州的土兵已调遣到松潘，协助当地的守卫，因此四川的巡按李化龙便上疏朝廷，请求暂时免于审核杨应龙，让杨应龙戴罪立功。从此事起，四川、贵州的抚按官上疏朝廷时就判然有别，四川的抚按官认为杨应龙没有什么可以审核的罪状，而贵州的抚按官则认为四川官员有徇私隐瞒杨应龙罪行的意图。于是给事中张希皋等人认为此事非同小可，事关四川、贵州两省的利害，请求朝廷会合两省官员从公心出发，一同审核此事，不要造成成见。十九年，叶梦熊主张播州所管辖的五个司全改由流官治理，隶属重庆，与李化龙的意见又绝然不同。李化龙于是因有嫌疑而遭排斥。杨应龙原本就是一个猜忌狠毒之人，倚仗自己有兵好杀人，他所管辖之下五个司的七大姓都叛离了他。他的宠妾田氏不仅屠杀了他的妻子张氏，还累及到张氏的母亲。他妻子的叔叔张时照与部下的何恩、宋世臣等人一起向朝廷报告紧急事变，密告杨应龙谋反。叶梦熊请求朝廷发兵征剿，而四川的士大夫都认为四川三面与播州相邻，杨氏家族的后代和属下的人数在四川是以十以百计，全靠杨应龙来管束弹压的，况且杨应龙的土兵骁勇善战，朝廷数次征调他们都立有功劳，将他们剪除掉不是长久之策。因此，四川的抚按官员一致主张招抚。朝廷讨论后命令对杨应龙进行勘查，杨应龙表示愿意到四川去接受审查，而不愿到贵州。
二十年(1592)，杨应龙到重庆接受审讯，按法律他应当被斩首，他请求愿出二万金赎罪。御史张鹤鸣正辨别审问他的罪状，碰到倭寇大举入侵朝鲜，朝廷广征天下的军队，杨应龙便上奏朝廷，愿带五千军队前去征讨倭寇以替自己赎罪。皇帝下诏释放了他。他率军队已经启动出发了，不久下面的官府上报说杨应龙已罢兵不出了。巡抚王继光，严厉提审调查此事，杨应龙抗命不出。张时照等人又到朝廷上奏此事，王继光对杨应龙用兵的提议便被通过。二十一年，王继光到重庆，与总兵刘承嗣等人分兵三路向娄山关进发，屯驻在白石口。杨应龙假装约定日期投降，而带领苗族土兵占据关隘冲击官军。刘承嗣兵败，其部下被杀死杀伤一大半。碰到王继光被定罪罢官，官军即撤兵，丢弃的辎重几乎都被抢光。贵州的军队前去协助进剿，也无功而返。这时，四川新上任的巡抚谭希忠与贵州的镇巡官和巡抚再商量进剿事务，御史薛继茂主张招抚他。杨应龙向朝廷上书自白，派遣其同党携带金子进入京城行贿，将原奏者何恩绑到綦江县。
二十二年(1594)，兵部侍郎邢。。总督贵州事务。二十三年，邢。。到达四川，察觉永宁、酉阳都有杨应龙的姻亲，黄平、白泥等地则长期以来对杨应龙有深仇大恨，觉得应该剪除杨应龙的余党。于是他便发檄文给杨应龙，只要他前来认罪，可以不处死他。此时正好又碰上水西宣慰安疆臣替其父亲安国亨请求举行抚恤典礼，兵部尚书石星写下手札出示给安疆臣，要他到杨应龙那里催促杨应龙到官府认罪，便可赦免杨应龙的罪行。安疆臣便带着手札前往播州招抚杨应龙。此时，七姓大族害怕杨应龙出去后得以赦免罪行，因为四方的亡命之徒都逃窜、藏匿在该地区，倚仗杨应龙的反叛从中取利，因此，对朝廷官府过往的驿卒和文书，总是设置障碍阻拦。邢。。便传文给重庆知府王士琦，让他到綦江催促杨应龙到安稳听候审讯。杨应龙派其弟弟杨兆龙到安稳，建好馆舍，储备好干粮，到郊外叩头迎接王士琦，按礼仪隆重地向他敬献猪牛羊等礼物，并说：“杨应龙已将下面的罪魁祸首绑缚起来，在松坎等待判罪。杨应龙之所以不敢到安稳来，就是害怕坠入安稳的仇人所设下的无法预测的灾祸之中。请求阁下到松坎去接受杨应龙的认罪。”王士琦说“：松坎以往也是上奏勘查之地。”便一个人骑马前往。杨应龙果然双手反绑着立于道旁，见到王士琦后哭着请求免己死罪，情愿帮朝廷收执其他罪人，献上罚金，让自己享受安国亨的境遇。安国亨，也是以往遭到攻讦，因对自己的罪行感到害怕而不出自己的地界的人，所以杨应龙引用他的例子来比照自己。王士琦为此向邢。。请示，邢。。答应了杨应龙，杨应龙便将黄元等十二人绑缚起来献给官府。官府验明以后，将黄元等人抵杨应龙的死罪，判杨应龙输送四万金子帮助采伐树木以赎自己的罪，革去杨应龙的官职，让他的儿子杨朝栋代理他的职务，他的次子杨可栋留在官府追赎其父的罪行，黄元等人在重庆闹市被斩首，总督将此事处理结果上报朝廷。此时倭寇还没有消灭干净，兵部想对杨应龙缓一手以专事东方的倭寇；朝廷也因为杨应龙以往积有功劳，就同意了总督的处理结果，在松坎设置同知来治理该地，任命王士琦为川东兵备副使，负责弹压、治理该地区的事务。
杨应龙获宽大处理后，对所犯的罪行更不思悔改。不久，杨可栋在重庆去世，杨应龙就更加痛恨官府。他敦促官府将其儿子的尸体送回来归葬，没有结果。官府传文书给他，要他交完赎罪的金钱，他大言不惭地说：“我的儿子能活过来，银子就送到。”他带兵驱赶一千多僧人替他儿子招魂；分别派遣土目据守关隘。他还以优厚待遇招抚各地苗人，将苗人中的健壮者称为硬手；播州百姓中家底稍殷厚些的，财产都被他没收以供养苗族人。苗族人全都愿意出死力为他效劳。
二十四年(1596)，杨应龙带兵残害了余庆，抢劫了大阡、都坝地区，对草塘、余庆二个司和兴隆、都匀各卫所实行焚烧抢劫，还派其同党包围黄平，杀戮了重安长官全家，其势又大为旺盛。二十五年，流动抢劫了江津和南川，兵临合江索讨他的仇人袁子升，将袁子升用绳缒到城墙下车裂而死。此时，兵备王士琦被调派去征讨倭寇，杨应龙便统领苗兵大肆劫掠贵州洪头、高坪、新村等屯。之后，又侵犯湖广的四十八个屯，阻塞驿站交通。他还刺探原先上奏要求惩罚他的仇人宋世臣和罗承恩的下落，知道他们带着家属隐藏在偏桥卫，便攻破该地，在城中大肆搜索，杀戮他们的父母，奸淫他们的妻子女儿，其行为非常悲惨残酷。
二十七年(1599)，贵州巡抚江东之命令都司杨国柱带领三千士兵进剿杨应龙，争夺三百落。贼人假装败北，将官军诱入三百落全部歼灭，杨国柱等人全部战死。江东之为此被罢官，以郭子章代理江东之的职务，起用李化龙节制四川、湖广、贵州等地的军事，调拨东征的刘纟廷、麻贵、陈瞞、董一元等将领南征。此时杨应龙乘大军还未集结，带兵进犯綦江。綦江城内新招募的士兵还不满三千人，贼兵八万人掩杀过来时，游击张良贤带兵与杨应龙展开巷战，结果战死，綦江陷落。杨应龙尽杀城中百姓，把尸体投入江中后把江面都盖满了，江水也全被血水染红。杨应龙还勾结九股地区没有汉化的苗人和黑脚苗人协助自己，屯兵官坝，声称要伺机进攻四川。不久，他又带人焚烧了东坡、烂桥、湖南、贵州等地的路标。
二十八年(1600)，杨应龙率兵五路齐发，攻破龙泉司。此时总督李化龙已移驻到重庆，所征调的军队也已集结，便在二月十二日誓师，分八路进军。这八路军队中，每一路约有三万人，其中朝廷所调拨的官兵占三成，土司地区征调的土兵占七成，旗鼓甲仗森严壁垒而列，苗人大为惊慌。总兵刘纟廷攻破其前锋，杨朝栋只身逃脱，贼人为此丧胆落魄。于是官军便连续攻克桑木、乌江、河渡三个关隘，夺取了天都、三百落等地的粮囤。贼人遭受连续失败后，乘间隙突然进犯乌江，诈称官军在水西的陇澄会师，诱骗永顺的土兵进入该地后，突然斩断桥梁，淹死将士无数。不久刘纟廷攻破九盘，进入娄山关。娄山关是贼人的前门，关上万峰耸天，中间只有一条小路可通。刘纟廷从山间小道上攀藤而上，破除栅栏，攻陷了娄山关。四月初一，官军屯驻在白石，杨应龙率领各地苗兵与官军决一死战。刘纟廷亲自勒马冲击杨应龙的中坚苗兵，又派兵从两翼夹击，将杨应龙打败，追击到养马城，又连续攻破龙爪、海云等险要的村屯，直逼海龙囤。这些都是贼人所倚仗的天险，所谓飞鸟和猿猴都过不去的地方。此时，偏、沅两地的官军已攻破青蛇囤，安疆臣也夺取了落氵蒙关，到达大水田，焚烧了桃溪庄。贼人见形势危急，父子相互抱头痛哭，上囤死守并给每路官军递投降书，以缓官军进兵的速度。总兵吴广进入崖门关，扎营在水牛塘，与贼人力战三天，打退了敌人。贼人施诡计，让一个女人在囤上拜表痛哭，边哭边说“：田氏向官军投降。”又诈称杨应龙已仰头喝药而死，将此报告给吴广。吴广轻信此言，按兵不动。不久，吴广发现了贼人的诈计，用兵猛攻，焚烧了二个关隘，夺取了贼人砍柴汲水的道路。八路大军集结到海龙囤，筑起了长长的包围圈，轮番向贼人发动攻击，贼人知道此次必死无疑。碰上李化龙的父亲新近逝世，皇帝下诏让他在军中带孝作战。李化龙认为贼人所居的前囤地势太险无法逾越，命令马孔英率领劲兵猛攻后囤。天气老是下雨，将士们在泥淖中苦战。六月四日，天气忽然晴朗，刘纟廷身先士卒，攻克土城。杨应龙感觉更加紧迫，散发金子招募死士为他抗拒官军，没人响应。杨应龙起身，提着刀到堡垒上巡视，看见四面火光冲天，大批官军已登上囤，攻破土城杀了进来。杨应龙便仓皇地同二个爱妾一起在室内自缢，并引火自焚。吴广抓获了杨应龙的儿子杨朝栋，急忙寻找到杨应龙的尸体，冲出火焰。贼人的叛乱终于平息。
从出师到消灭贼人历时一百一十四天，八路大军共斩敌人首级二万多个，活捉杨朝栋等一百多人。李化龙将此大捷公开上报，将俘虏献到朝廷，用锉磋磨杨应龙的尸体，将杨朝栋、杨兆龙等人在闹市车裂。播州从唐朝归入杨氏，传了二十九代，达八百多年之久，到杨应龙手上终于灭亡。
三十一年(1603)，播州残余的逆贼吴洪、卢文秀等人又发生叛乱，总兵李应祥等人带兵讨伐平定了他们。朝廷于是便将播州一分为二：属四川的部分称为遵义府；属贵州的这一部分称为平越府。
永宁，唐朝时称为蔺州。宋朝时，该地在泸州的江安、合江二个县的境内。元朝时，此地设置了永宁路，统领了筠连州和腾川县，后来此地又改为永宁宣抚司。
明朝洪武四年(1371)平定了四川，永宁归附朝廷，朝廷在此设置永宁卫。六年，筠连州滕大寨的蛮人编张等发动叛乱，伪称自己是云南的官军，占领了湖南长宁各州县，朝廷命成都卫指挥袁洪前去讨伐。袁洪带兵到叙州的庆符县，攻破了清平关，活捉了他们自封的千户李文质等人。编张逃走后，又带兵进犯江安各县。袁洪带兵追击，又打败了他们，焚烧了他们九个寨子，俘获编张的儿子、自封的镇抚张寿。编张逃跑后藏匿在溪洞里，他的余党散入云南。皇帝听到报告以后，赐谕给袁洪说：“南方的蛮族人时而叛乱时而又归顺没有一定的准则，对他们不足以加罪。既然已经抓获了俘虏，就将这些俘虏编入军队之中，驻扎在边境之上。对待他们就是要以军队震慑，使他们对我天朝的威风有所畏惧，这样就不会留下后患。”不久，编张又聚众占领了滕大寨，袁洪带兵讨伐并打败了他们，追到小芒部时，编张逃跑了，于是攻取了得花寨，活捉了阿普等人。从此以后，编张再也不敢出来了，他们的寨子也都被扫平。于是朝廷便把筠连州降为县，让其隶属于叙州，将九姓长官司隶属于永宁安抚司。
七年(1374)朝廷将永宁等处军民安抚司升为宣抚使司，官秩为正三品。八年，朝廷任命禄照为宣抚使。十七年，永宁宣抚使禄照向朝廷献贡马，皇帝下诏赏赐给他钱钞、冠和衣服，规定他们每三年向朝廷入贡一次。十八年，禄照派他的弟弟阿居来朝觐皇帝，说近年来应该交纳的赋马都已交纳了，只有粮食无法如数完成。原因是大军向南征讨，蛮族百姓惊慌逃窜，无法按时耕种，加上打仗以后疾病瘟疫流行，死亡的人很多，所以来不及收缴和运送粮食。皇帝下令蠲免。二十三年，永宁宣抚上奏说，他所管辖的地盘内有水道一百九十滩，其中的江门大滩有八十一处，石头都将水流堵塞了。皇帝下诏书，命令景川侯曹震前去开凿疏通。二十四年，曹震到泸州巡察，看到有支流通往永宁，便凿去石头、削平崖壁、疏通河道以通漕运。
二十六年(1393)，禄照的儿子阿聂继承其父的职务。此前，禄照因犯法被逮到京城，在他向朝廷申述清楚后回去时，死在途中。这时禄照的儿子阿聂和弟弟阿智都在太学里学习，于是朝廷便让阿聂的庶母奢尾掌管宣抚使司的事务。到二十六年时奢尾进京朝觐，请求朝廷让阿聂继承其父的职务，皇帝同意了。永乐四年(1406)，朝廷免除了永宁荒田的租赋。
宣德八年(1433)，已故宣抚阿聂的妻子奢苏进京朝觐献贡物。九年，宣抚奢苏上奏说“：我们这里学习儒学的学生都是当地的僚族人，朝廷所教授的官话他们听不通，因此难以训诲他们。永宁的监生李源资质厚道学识贯通，请求朝廷比照云南鹤庆府的例子，授予他儒学训导。”皇帝下诏同意这个建议。景泰二年(1451)，朝廷同意了布政司的请求，减免了永宁宣抚司的税课和部分钱钞，因该地苗族人悄悄作乱，客商不通，路途阻绝的缘故。
成化元年(1465)，山都掌、大坝等寨子的蛮族贼人分别抢劫了江安等县，兵部将此事上报朝廷。二年，国子监学录黄明善上奏“：四川山都掌的蛮族贼人每年都出没无常，杀害掠夺良民。景泰元年(1450)招抚了他们，不久又叛乱。天顺六年(1462)招抚他们后又造反。近来总兵李安命令永宁宣抚奢贵赴大坝招抚他们，也没有效果。恐怕开战已不可避免，所以应该及早集结大军，早点决定计划，不使边关酿成祸患。”三年，黄明善又上奏“：宋朝时多刚县的蛮族入侵，朝廷派白刀艹子兵就将他们平息了。白刀艹子，就是今天的民壮人；多刚县，就是今天的都掌多刚寨。前朝使用乡兵有明显效果，所以我们也应紧急招募民壮人，让他们协助官军。都掌的水稻十月份就成熟，应带兵在此之前将其水田里的稻禾抢收过来，这样蛮族人三个月之内必然没有粮吃。这时官军可以分成三路进剿：南路从金鹅池向大坝攻击；中路从戎县向箐前进攻；北路从高县向都掌进攻。一旦小寨被攻破了，其大寨自然就被攻拔了。大坝往南一百多里远的地方是芒部，往西南二百里远的地方是乌蒙，命令这二个府的土官截住险要之地。再用火器自下而上顺风放火焚烧，这样蛮族人的寨子一定可以攻克。当然征调土兵必须处置妥当，招募民壮人也必须赏罚分明讲究信义。”皇帝下诏让总兵官参用这条建议。此时总督尚书程信也上奏“：都掌的地势险要，一定要有土兵当向导才行。请求皇上谕告东川、芒部、乌蒙、乌撒各府的土兵，并急速调拨湖广的永顺、保靖的军队，让他们准备随时出征。”之后，又请求从南京调战马一千匹应用。皇帝都同意了这些请求。四年，程信上奏说“：永宁宣抚奢贵开通了运道，擒住了贼人的首领，皇上应降印有皇帝玺印的诏书奖励他。”皇帝同意。
十六年(1480)，白罗罗的羿子与都掌大坝的蛮族互相攻击，礼部侍郎周洪谟说“：我是叙州人，了解叙州蛮族的情况。戎、珙、筠连、高各县在前朝都是土官统治，只有在我明朝才开始以流官代替土官前来治理。流官与蛮族人之间言语不通、性情不一，造成激变。洪武、永乐、宣德、正统四代皇帝命令将士四出征讨，蛮族人的叛乱更加滋蔓，至今还顽固不化。我以前曾经说过从长远考虑，在这些地区应仍设立土官来治理。都御史汪浩侥幸获得边功，欺骗杀害了官府保护的土官和寨主二百多人，各地蛮族人对他怨入骨髓，转而大肆劫掠。等尚书程信统领大军才能克服他们。我认为现今不如顺从蛮族人的情况，挑选出他们公推信服的人做大寨主，让他世袭官职管理当地蛮族群众，这样才能相互平安。”他又说：“白罗罗，相传是广西的流动的蛮族人，有数千人之多，没有人统属他们。景泰中年，他们纠集了戎县、珙县的苗族人，攻破了长宁等九个县，现今又侵扰都掌。他们居住的地方，崖险箐深，很难将他们剪除消灭。对他们也应该设立长官司来治理。他们的居住地，靠近芒部，应隶属于芒部。羿子，归永宁宣抚所管辖。永宁是云南、贵州的要冲之地，南跨赤水、毕节六七百里，让一个柔弱的女人来节制数万强梁之徒，所以每每有大肆抢劫行为。我认为宣抚司中的土著僚人，仍然归宣抚奢贵治理，而其南部各寨靠近赤水、毕节等要道的蛮族人，应设立二个长官司来管理，这二个长官司仍隶属于永宁宣抚。土官有职务而无官俸，对国库没有损害，对边防反而有益。”皇帝同意他的这些建议。嘉靖二十五年(1546)，永宁宣抚司女土官奢禄向朝廷进献大木，皇帝按惯例给予封赠。
万历元年(1573)，四川的巡抚曾省吾上奏朝廷：“都掌的蛮族叛逆，调拨军队前往征讨时，土官奢效忠首先在调拨之列。但奢效忠与贵州的土官安国亨有仇，请求朝廷一并下令给总兵官刘显节制他们，使他们不能找借口复仇。”皇帝同意。当初之时，乌撒与永宁、乌蒙、水西、沾益各土官的辖地边境相连，他们之间又世代有亲戚，亲情很厚。不久安国亨杀死安信，安信的兄长安智勾结永宁宣抚奢效忠报仇，彼此相互攻杀。安国亨手下的吏目与安智有亲戚关系，怕被安国亨斩杀，就投奔安路墨。安路墨冒充土知府安承祖，赶赴京城代奢效忠向朝廷上奏。不久安国亨也派他儿子安民向朝廷陈述事情的经过，安国亨与奢效忠都奉命听从四川、贵州巡抚的审核。四川、贵州巡抚审核后建议依照蛮族人的习俗罚牛赎罪，皇帝认为可行。奢效忠死后，他的妻子世统没有儿子，他的妾世续有一个幼小的儿子名叫崇周。世统认为自己是嫡妻，想夺取官印，便与世续互相仇杀。此事正向朝廷奏报期间，总兵郭成、参将马呈文利用他们的权力，突然发兵千余人，深入到落红。奢氏家族传了九代的积蓄，被搜刮抢劫一空。世续也派兵尾随郭成等人之后进入落红。奢效忠的弟弟奢沙卜出来抗拒，并邀集水西的土兵前来报仇。郭成的军队打了败仗，便向世统下檄文，要她去抓奢沙卜。世统不答应，郭成便又杀了三个把总，聚集苗兵一万多人，想进攻永宁以泄怨气。巡按官弹劾郭成为谋利挑起事端，应遭逮捕；并建议朝廷给奢效忠的妻妾二人授予冠带，将奢效忠原有的领地分开，由她们各管自己所属的部分，宣抚司的官印暂时封存，等奢崇周长大成人，赴京继承官职处理事务时才交付给他。皇帝认为此议可行。十四年，奢崇周代理其父的官职，不久死亡。
奢崇明，是奢效忠的亲弟弟奢尽忠的儿子。他从小是个孤儿，世统抚养了他一十三年。至此，将他送到永宁，世续送给他毡和马，并答应将宣抚司的官印交给他。本来事情已这样安排定了，不料阎宗传等诸位奸人认为以前自己跟随世续驱逐世统，杀死了奢沙卜，害怕奢崇明即位后，报以前的仇恨，于是依附于水西，拥立阿利以保护自己。安疆臣对他们两派阳奉阴违，纵容蛮族土兵四出焚烧抢劫屯堡，官兵都无法禁止他们。总督将此事上报朝廷，朝廷讨论后任命奢崇明暂时管理宣抚司事务，希望奢崇明能减少夙恨，广收人心。此时阎宗传等人依然如故地攻掠永宁、普市、摩尼等地。奢崇明承袭宣抚使职务近一年了，世续竟然还不把官印交给他，却私下交给安疆臣的妻弟阿利。巡抚派都司张神武将世续抓起来索讨官印，世续说官印在镇雄的陇澄那里。
陇澄，就是水西的安尧臣。陇氏家族快要绝种时，安尧臣入赘到陇家，于是冒称自己姓陇，叫陇澄。前文所叙述的讨平播州、叙州的功劳中，陇澄也参与在内，而中央官员根本就不知道他是安尧臣。安尧臣在外依仗自己在播州所立的功劳，在内依靠水西的势力，有占据镇雄节制永宁的野心。四川的抚按官以安尧臣不是陇氏的血脉，不授予他镇雄陇氏家族世袭的官职。安尧臣因此心怀两端，暗地里帮助世续。他的意图是世续将永宁的官职授予阿利，则自己所占据的镇雄会更加牢固；况且朝廷现在厌兵不愿动武，阎宗传、阿利等人又刚开始骚乱，自己完全可以躺着取代陇氏。而阎宗传等人每次焚烧掠夺，都称自己是镇雄的军队，以此吓唬各部落。川南道梅园楼所俘获的蛮族人丑者说，镇雄府派遣将领鲁大功率五个营的军队屯驻在大坝，水西的兵也渡过马铃堡，相互约定进攻永宁，普市的人于是全都溃散，阎宗传等人因这是一座空城便弃之而去。奢崇明又说，安尧臣所派的目把彭月政、鲁仲贤等人率六大营军队帮助叛逆之贼，声称将抵达叙南，进攻永宁和泸州。于是，总兵侯国弼等人，都把罪恶归咎于安尧臣。都司张神武等人所抓的俘虏唤者、朗者，都是镇雄府的土目，安尧臣也无法辩解。
贵州的抚按官以西南地区多兵事，军粮都已用完为由，无意进取镇雄府。安尧臣因此就把普市、摩尼等地的焚烧掠夺，都归到四川将领的头上。朝廷中也有议论，认为四川的将领有贪功而挑起事端的罪行。四川巡抚乔璧星上奏说“：安尧臣很狡猾，老谋深算，想篡夺镇雄府的大权，垂涎蔺州已有年头了。阎宗传之所以敢背叛朝廷就是倚仗镇雄府的势力，就好像镇雄倚仗水西一样。水西的安疆臣没有出兵助逆，我已探明了他们的情况，所以应乘叛贼恶势力还未形成，命令贵州抚按官与我一起会合，前去进剿。倘若安尧臣仍像以前一样酝酿作恶，我即带兵前去击碎他，不让小虫变成蛇，不使堵塞了的裂缝变成河。”这疏章上奏皇帝后，朝廷大臣讨论中竟然没有人敢决定对安尧臣用兵。时间长了以后，阿利死了，官印也交出来了，四川官员中想驱逐安尧臣的想法，最终还是没结果。此时播州清疆的议论正热烈，贵州、四川各地也搞得纷纷扬扬。到此，永宁该不该用兵的讨论就像聚在一起诉讼一样。此时，朝廷已经一心一意想休兵。三十五年(1607)，皇帝下令释放奢世续，赦免阎宗传等人的罪行，寻访陇氏的子孙来继承镇雄府的官职。并命令安疆臣约束安尧臣，把安尧臣带回本土司，听令遥授职务官衔，不许他假冒姓氏继承陇氏的职务。这样，阎宗传便投降朝廷，安尧臣也请求避到本土司去，贵州的总督于是便请求撤回军队。
按旧制度，永宁卫隶属于贵州，而其中的土司又隶属于四川。自从水西与蔺州相互攻击后，军民激变。奢崇明虽然继承了永宁的官职，但官员的审核并未上报朝廷。摩尼、普市的千户张大策等人又请求朝廷将永宁宣抚改为流官。兵部认为，无缘无故地改由流官统治，将把奢崇明置于何地？便命令有关官员迅速完结以前审核的诸案。于是四川巡抚拟定张大策犯有失守城池罪，应当斩首；贵州巡抚则拟定张神武犯有擅自动兵抢劫掠夺罪，也应当斩首。张大策，是贵州人，张神武，是四川人。因此两省都替本省的人打抱不平，各位大臣自己互相诉讼，纷纷扬扬解决不下来。此时又碰上奢崇明的儿子奢寅与水西已故土官的妻子奢社辉争夺领地，奢社辉所带领的安家的兵马数量十倍于奢寅的兵马，但奢寅的兵马很精锐，所以双方互相争持着。四川、贵州的抚按官无法节制他们，就将此状况上报朝廷。四十八年(1620)，贵州巡抚张鹤鸣认为赤水卫白撒所的屯地被永宁军队占据，应清理出来归还赤水卫。这些都有待于朝廷派官员审核后才能决定。
天启元年(1621)，奢崇明请求调拨骑兵和步兵二万人前去支援辽阳，皇帝同意了。奢崇明与其儿子奢寅长久以来蓄有异志，借调拨军队支援辽阳的机会，派遣女婿樊龙和部下同党张彤等人，带兵到达重庆后长期驻扎着不出发。巡抚徐可求亲自赶到重庆催促永宁军队赶快出发，樊龙等人以增加行粮为名乘机造反，杀死了巡抚、道官、府官、总兵等官员二十多人，占领了重庆。他们还分兵攻打合江、纳溪，攻破泸州，攻陷遵义，兴文的知县张振德战死。兴文，是以前九丝蛮的地方。他们又进军包围成都，号称自己的政权为大梁。布政使朱燮元、周著，按察使林宰等在成都城内分门固守。石石主土司的女土官秦良玉派其弟秦民屏、侄子秦翼明等发兵四千，日夜兼程，悄悄地渡过重庆，在南坪关扎营。秦良玉自己统率精兵六千沿江而上直奔成都。其他的援兵也渐渐集结起来。此时奢寅攻城很急，暗地里接纳刘勋等人做内应。事情被发觉后，刘勋等人被诛杀。奢寅等又造云梯和旱船，昼夜攻城。城中也以炮石还击他们。双方相持一百天，碰到贼军将领罗乾象派人向官军投诚，表示愿意杀死贼人为自己赎罪。这天晚上，罗乾象纵火焚烧军营，贼兵大乱，奢崇明父子仓惶出逃，丢弃的钱帛谷米堆得像山一样，穷苦的百姓靠此得以活命。罗乾象便率其同党胡汝高等人前来投降。此时朝廷已授予朱燮元巡抚职务，他率四川的士兵追击奢崇明，江安、新都、遵义等郡邑都收复过来了。这时是天启二年(1622)三月。樊龙将余部数万人收集起来，占据了重庆的天险和要塞。朱燮元督促秦良玉等人夺取二郎关，总兵杜文焕攻破了佛图关，诸将领将军队围着重庆驻扎下来。奢寅派贼人同党周鼎等分道来救援，周鼎被官军打败后逃走，结果被合江的百姓绑缚起来。官军与平茶、酉阳、石石主三个土司的土兵合围重庆，重庆城中缺粮。朱燮元便设计活捉了樊龙，将他杀了；张彤也被乱军所杀；生擒了樊龙的儿子樊友邦及其同党张国用、石永高等三十多人，收复了重庆。
此时安邦彦在贵州造反，奢崇明与他遥相声援。三年(1623)，四川的官军收复遵义，进攻永宁，在土地坎与奢寅相遇，双方率兵进行搏战。官军奋勇出击，叛军被打败，奢寅受伤后逃走，樊虎也战死了。官军进军攻克永宁城，降服了二万贼人。官军又进军攻拔了红崖、天台各囤寨，投降的人每天都有。奢崇明的势力越来越小，便向水西求救，安邦彦派十六个营的军队过河前来支援他。罗乾象攻破了蔺州，焚烧了九凤楼，他的老巢覆灭了。奢崇明踉踉跄跄地逃走了，投奔到水西。安邦彦与奢崇明合兵一处后，分别侵犯遵义和永宁。四川的官军在芝麻塘将他们打败，他们便逃进了青山。各位将领逼近渭河，在龙场与奢崇明激战，俘获了奢崇明的妻子安氏和奢崇辉等人，斩杀的人数以万计。蔺州平定了，总督朱燮元向朝廷请求以赤水河为界，河东的龙场隶属于贵州，河西的赤水、永宁隶属于四川。在永宁设置了道和府，与遵义、建武声势相联。
不久，贵州巡抚王三善遭安邦彦的袭击而死，奢崇明的势力又有扩张，过了春天将大举进攻永宁。此时正好奢寅被其部下所杀，朱燮元亦因父亲亡故离开军队去奔丧了，奢崇明、安邦彦得以苟延残喘。奢崇明自称为大梁王，安邦彦号称自己为四裔大长老，其下称元帅者不可胜数。他们合兵十多万人，规划先进犯赤水。崇祯初年，朝廷起用朱燮元来总督贵州、湖广、云南、四川、广西等地的事务，会师讨伐。朱燮元定下计谋诱使贼人向永宁深入，然后在五峰山的桃经坝邀击他们，再命令总兵侯良柱率军大败他们，奢崇明、安邦彦都被俘斩首。这一仗，扫荡了四川、贵州几十年来都没有去除的大恶贼，这是朱燮元的功劳。
酉阳，汉朝时是武陵郡的酉阳县。宋朝时，此地为酉阳州。元朝时隶属于怀德府。
明朝洪武五年(1372)，酉阳军宣慰司的冉如彪派其弟弟冉如喜前来进觐献贡，朝廷便设置了酉阳州，任冉如彪为知州。八年，酉阳州改为宣抚司，仍让冉如彪担任宣抚使。其下设置平茶、邑梅、麻兔、石耶四个洞的长官司，任命杨底纲、杨金奉、冉德原、杨隆为长官司长官，让他们每三年入京城献贡物一次。石耶洞长官不能亲自到京城来，朝廷便命令他将贡物附在酉阳宣慰司一起带来。二十七年，平茶洞长官司长官杨再胜，阴谋杀害兄长的儿子杨正贤和洞长杨通保等人。杨正贤等人觉察后逃到京城，向朝廷诉说此事，并称杨再胜与景川侯一起阴谋造反。皇帝命令将杨再胜逮捕审讯，杨再胜服罪，按法律此罪应诛杀九族，因此杨正贤也应治罪。皇帝诛杀了杨再胜，释放了杨正贤，让他继承了长官司长官职务。酉阳宣抚冉兴邦也因承袭了官职前来京城朝觐，皇帝便命令将酉阳宣抚司改为隶属于谕州。
永乐三年(1405)，指挥丁能、杜福招抚了亚坚等十一个寨子里的没有汉化的苗族人共一百三十六户，告诉他们各派遣儿子入京城朝觐皇帝，皇帝命令他们隶属于酉阳宣抚司管辖。四年朝廷免除了酉阳荒田的租税。五年，冉兴邦派遣部落酋长龚俊等人向朝廷贡献土产，并感谢皇上允许在当地设立儒学的恩典。
景泰七年(1456)，朝廷调拔宣抚佥事冉廷璋的军队，去征讨五开、铜鼓等地叛乱的苗族人，皇帝赐谕给他们奖赏。天顺十三年，皇帝命令给宣抚冉云进散官一阶，因为他帮助讨伐叛乱的苗族人和擒捉石全州有功劳。
弘治七年(1494)，宣抚冉舜臣因在征讨贵州叛乱的苗人中立有功劳，请求朝廷提升他的职务。兵部认为没有提升土司职务的惯例，请求朝廷给冉舜臣的官阶进到明威将军，赐谕褒奖他。十二年，冉舜臣上奏说宋农寨的蛮族贼人纠集起来，胁迫各寨洞的蛮人去烧杀抢劫，请求朝廷派兵进剿搜捕。保靖、永顺二个宣慰也上奏说邑梅的副长官杨胜刚父子阴谋占领酉阳，勾结俊信洞的洞长杨广震等人，号召宋农、后溪等地的蛮族人聚兵烧杀抢劫，请求朝廷派兵一并讨伐。兵部商议后认为酉阳各溪洞之间相互联络，容易煽动作乱，应立即将其扑灭，请各地的镇巡官相机行事。十四年朝廷调拨酉阳的军队五千人协助官军进剿贵州的女贼人米鲁。
正德三年(1508)，酉阳宣抚司的护印舍人冉廷玺和邑梅长官司上奏，说湖广的镇溪所洞的苗人聚众攻掠抢劫，请求朝廷派兵进剿搜捕。八年，宣抚冉元向朝廷进大木二十根，请求朝廷免去其儿子冉维翰继承官职时须赴京城朝觐的任务，皇帝同意了。二十年，冉元又向朝廷进献大木二十根，皇帝下诏按情况赏赐给他一定颜色的衣服。
万历十七年(1589)，宣抚冉维屏向朝廷献大木二十根，价值超过三千。工部讨论，认为应给冉维屏加赏从三品的衣服，以劝勉土官向朝廷献忠诚，皇帝同意了。四十六年，朝廷调拨酉阳兵四千人，命令宣抚冉跃龙带领着去支援辽阳。四十七年，冉跃龙派遣儿子冉天胤及冉文光等带兵赶赴辽阳，驻扎在虎皮、黄山等地达三年，解除了敌人对奉集的包围。他们又援救沈阳，因在浑河失利，冉见龙战死，同时阵亡的还有一千多人。他们撤回军队守卫辽阳时，又被已投降的敌人放火焚烧，冉文焕等人战死，同时死亡的还有七百多人。兵部尚书张鹤鸣说：“冉跃龙派遣子弟不远万里前来保卫朝廷，冉见龙已以身殉国，冉跃龙又自己捐献二千金黄金，运送军用器械到山海关，帮助军队摆脱困境，招回和振奋了军魂军威，其对朝廷确实忠义可嘉。我在贵州时，冉跃龙也自己捐献粮饷主动征讨叛乱的红苗人，屡次建立奇功。现今他在边关地区又以忠节于朝廷而著称，朝廷应对他优加抚恤，以感化各边关的土著人。”
天启元年(1621)，朝廷授予冉跃龙宣慰使的职务，其妻舒氏也被授予诰命。还抚恤了阵亡将士家庭一千七百多家。二年，奢崇明叛乱，冉跃龙率军前去支援官军，与官军一起包围了重庆。在诛杀奢崇明的战斗中，他手下的土舍冉绍文也参加了并立有功劳。四年，冉跃龙因奉朝廷调遣前往别处效命，便向朝廷请求优抚他的弟弟冉见龙和各阵亡将士的家庭，皇帝命令将该请求交有关机构办理。
崇祯九年(1636)，宣慰使冉天麟上疏朝廷“：作恶的冉天胤，假传圣旨阴谋夺取我的官爵和土地，没有成功，便擅自带兵残杀。”朝廷将该奏章交给抚按官去调查审核。此时四川正为盗贼所困扰，各位大官自顾尚不暇，对土官的事便多束之高阁了。
犒劳杨爱。十四年，朝廷从播州调拨了五千人前去征讨贵州的贼人女首领米鲁等。
正德二年(1507)，播州宣慰使杨斌晋升为四川按察使，仍掌理宣慰事务。按照原先的制度，土官有功劳，朝廷给他赏赐衣带，或用旗帜奖赏他的部众，没有升官衔的。杨斌狡猾专横，不受两司的节制，唆使安抚罗忠等人上报他平定普安的战功，用重礼贿赂刘瑾，终于得以升职。过了一年，巡按御史俞缁说不应该授予杨斌四川按察使的官衔，便将他裁了，让他仍任原职。
早先，杨友既已被迁到保宁受管制，杨爱就更加恣意妄行，用从百姓中收刮来的财物贿赂中央的贵族，然后出兵夺取杨友以往的居住地凯里。同知杨才居住在安宁，乘此机会压迫剥削百姓比以往更甚，苗人很怨愤。凯里的百姓替杨友上奏要求恢复杨友的官职，不得，便潜入保宁，将杨友抢了回来，然后纠集众人作乱，攻打播州，焚烧了杨爱的居所和公私官邸，杀了杨才，还残戮了许多其他人。杨爱为此屡次上奏朝廷，皇帝命令镇巡官调拨军队前去征讨。此时杨友死了，于是军队便缓出。不久镇巡官说：“杨友的儿子杨弘能够悔过自新，而且善于招抚驾驭百姓，蛮族群众愿意听从他的号令约束。以前被杨友所焚烧杀害的，都已随当地习俗折价赔偿，同时还归还以前侵夺的东西给官府。我们请求朝廷授予杨弘冠带，封他为土舍，让他协同播州经历司招抚各族。他的家属已迁移安置到保宁的，允许他们回凯里，仍隶属于播州，受播州管辖。并谕告杨斌和杨弘通和，不得再制造争端。”该提议上报朝廷后，朝廷同意了。不久，播州安抚宋淮上奏说“：贵州凯口烂土的苗族人与凯里草塘诸寨子里的番族人结婚，暗地里相互勾结，诱使山里的苗人作乱。请求朝廷给杨斌颁敕谕，令他每年巡视边境，会同湖广镇巡官一起安抚处置。”兵部讨论认为土官中向来没有带着皇帝的敕谕出巡的，便谕告杨斌应安抚妥当当地的百姓，与亲族和睦相处，不辜负朝廷对他的优待。接着给已辞官在家的宣慰杨爱授昭毅将军的称号，皇帝给他颁布授官的诏令，赏赐绣有麒麟的衣服。这时杨斌又出面替他父亲请求晋升官阶和服装的颜色，礼科驳回他的请求，认为服装的颜色是等级威仪的象征，不能掺假。兵部则认为杨爱以前剿贼有功，答应了杨斌为其父亲所提的请求。杨斌又请求让其儿子杨相进国子监学习，得到朝廷的同意并得到皇帝所赐的冠带。
十二年(1517)，播州安抚罗忠、宋淮等人给朝廷上奏：“杨斌有父丧在身，想援引朝廷文官的例制替父亲守孝，但边关防务很重，请求朝廷让他在父丧期间仍掌管官印处理事务。”原初，杨弘回归凯里，与重安的土舍冯纶等人有怨。杨弘死后，冯纶诱使苗族人进攻凯里，这样双方便构怨仇杀，其祸害超出了贵州边境。巡抚邹文盛向朝廷描述了相互仇杀的状况，请求朝廷移文到四川，让贵州、四川的官员会同一起去招抚处理此事。该请求过了一年没有消息。邹文盛便派遣参议蔡潮进入播州，督促已辞官在家的杨斌出面安抚平定这场仇杀。因此邹文盛又上奏说：“应该恢复安宁宣抚，让杨弘的子弟承袭这个官位。杨斌还未衰老，应该再起用他，让他节制各蛮族人居住的寨子。蔡潮有招抚蛮族的功劳，应根据其功劳提升他的官职。”兵部讨论说“：安宁宣抚已经革除了就不能再恢复了，杨斌的儿子既然已经代理了其父的职务，杨斌自然也不能再起用了。土官是否应该继承原有官职，属于四川的事，不能由贵州说了算。邹文盛的请求难以施行，但其功劳不能抹杀。”十六年，朝廷赏赐给杨斌绣有蟒纹的衣服和玉腰带。
嘉靖元年(1522)，皇帝听从宣慰杨相的奏章，给播州儒学赏赐了四书集注。杨弘已经死了，他的弟弟杨张请求继承杨弘的职务，不得，便时常在边疆地区抢劫，抢走了白泥司的印信，又与杨相构兵为仇。当地守卫大臣请求朝廷将凯里改为隶属于贵州，以杨张为土知州。兵部讨论说：“杨张学得了其父兄的恶习，幸免于被杀；现在竟敢公开抢夺印信来要挟朝廷，应当命令四川、贵州的守卫大臣按其以前和最近所犯的争夺财产、杀人等罪状，按理处置。要是杨张能够向朝廷表示悔过，归还其所获的印信，尚可按情况授予他一个官职，让他听从朝廷的调遣去杀贼立功，赎自己的罪。要是他坚持作恶到底，必杀他以为那些玩弄法律者戒。”后来，答应让杨张继承宣抚官职，将安宁改为凯里，隶属于贵州。
当初，杨相的祖辈都是因为庶子与嫡子之间的争端，遗祸几世。到杨相时，他又宠爱庶子杨煦。杨相嫡子杨烈的母亲张氏，为人剽悍，与杨烈一起带兵赶走了杨相。杨相逃跑后，死在水西。杨烈到水西去索回父亲的尸体时，宣慰安万铨就要挟杨烈，要他将水烟、天旺两个地方归还给安万铨，然后再还尸体给杨烈。杨烈表面上答应了。等杨相的尸体归丧以后，杨烈吝惜土地坚决不给安万铨，于是便与水西方面结仇，还杀死水西的长官王黻。这是嘉靖二十三年(1544)的事。
杨烈继承父亲的官职之后，便与王黻的党徒李保带兵互相攻击，时间延续近十年。总督冯岳调拨总兵石邦宪将他们讨伐平定。真州的苗族人卢阿项也长期作乱，石邦宪用七千军队将其击败。有传言说贼人已向播州求援，石邦宪说：“我刚调遣水西的军队，说杨烈有帮助叛逆的罪行，杨烈还有功夫去救别人吗？”不久，石邦宪生擒了卢阿项父子，斩杀和俘获敌人四百多。原先，在嘉靖初年时，朝廷商议将凯里分出来，让其隶属于贵州。后来，又因为播州的土地大多都在贵州境内，就将凯里改成隶属于思石兵备。真州的盗贼被扫平以后，地方安宁了，播州人认为将凯里划归思石兵备很不方便。四川、贵州的守卫大臣也因意见不同无法决定，朝廷便命令总督合同两地的大臣前去审核。总督便向朝廷上奏，说仍将播州归四川管辖，而让贵州的思石兵备仍兼管播州、酉阳、黄平、邑州等地的土司事务。皇帝同意这种安排。
隆庆五年(1571)，杨烈死，其儿子杨应龙请求继承父亲的官职，朝廷同意了。万历元年(1573)，皇帝下诏书任命杨应龙为宣慰使。八年，皇帝同意杨应龙的请求，赐已故宣慰杨烈祭葬仪式。十四年，杨应龙向朝廷进献大木七十根，木材非常好，皇帝给他赏赐绣有飞鱼的衣服。杨应龙又援引其祖先杨斌的例子，希望朝廷赏赐他绣有蟒纹的衣服。礼部讨论，认为杨斌以前立有军功，又是出于边远地区，皇帝才特别恩赐，才赏蟒纹衣服，杨应龙不能比照杨斌的例子受赏。皇帝便命令给杨应龙授予都指挥使的官衔。
万历十八年(1590)，贵州巡抚叶梦熊上疏朝廷，谈了杨应龙为凶作恶的事情；巡按陈效也上疏一一诉说了杨应龙二十四条大罪状。此时正好是加强松潘的防卫，播州的土兵已调遣到松潘，协助当地的守卫，因此四川的巡按李化龙便上疏朝廷，请求暂时免于审核杨应龙，让杨应龙戴罪立功。从此事起，四川、贵州的抚按官上疏朝廷时就判然有别，四川的抚按官认为杨应龙没有什么可以审核的罪状，而贵州的抚按官则认为四川官员有徇私隐瞒杨应龙罪行的意图。于是给事中张希皋等人认为此事非同小可，事关四川、贵州两省的利害，请求朝廷会合两省官员从公心出发，一同审核此事，不要造成成见。十九年，叶梦熊主张播州所管辖的五个司全改由流官治理，隶属重庆，与李化龙的意见又绝然不同。李化龙于是因有嫌疑而遭排斥。杨应龙原本就是一个猜忌狠毒之人，倚仗自己有兵好杀人，他所管辖之下五个司的七大姓都叛离了他。他的宠妾田氏不仅屠杀了他的妻子张氏，还累及到张氏的母亲。他妻子的叔叔张时照与部下的何恩、宋世臣等人一起向朝廷报告紧急事变，密告杨应龙谋反。叶梦熊请求朝廷发兵征剿，而四川的士大夫都认为四川三面与播州相邻，杨氏家族的后代和属下的人数在四川是以十以百计，全靠杨应龙来管束弹压的，况且杨应龙的土兵骁勇善战，朝廷数次征调他们都立有功劳，将他们剪除掉不是长久之策。因此，四川的抚按官员一致主张招抚。朝廷讨论后命令对杨应龙进行勘查，杨应龙表示愿意到四川去接受审查，而不愿到贵州。
二十年(1592)，杨应龙到重庆接受审讯，按法律他应当被斩首，他请求愿出二万金赎罪。御史张鹤鸣正辨别审问他的罪状，碰到倭寇大举入侵朝鲜，朝廷广征天下的军队，杨应龙便上奏朝廷，愿带五千军队前去征讨倭寇以替自己赎罪。皇帝下诏释放了他。他率军队已经启动出发了，不久下面的官府上报说杨应龙已罢兵不出了。巡抚王继光，严厉提审调查此事，杨应龙抗命不出。张时照等人又到朝廷上奏此事，王继光对杨应龙用兵的提议便被通过。二十一年，王继光到重庆，与总兵刘承嗣等人分兵三路向娄山关进发，屯驻在白石口。杨应龙假装约定日期投降，而带领苗族土兵占据关隘冲击官军。刘承嗣兵败，其部下被杀死杀伤一大半。碰到王继光被定罪罢官，官军即撤兵，丢弃的辎重几乎都被抢光。贵州的军队前去协助进剿，也无功而返。这时，四川新上任的巡抚谭希忠与贵州的镇巡官和巡抚再商量进剿事务，御史薛继茂主张招抚他。杨应龙向朝廷上书自白，派遣其同党携带金子进入京城行贿，将原奏者何恩绑到綦江县。
二十二年(1594)，兵部侍郎邢。。总督贵州事务。二十三年，邢。。到达四川，察觉永宁、酉阳都有杨应龙的姻亲，黄平、白泥等地则长期以来对杨应龙有深仇大恨，觉得应该剪除杨应龙的余党。于是他便发檄文给杨应龙，只要他前来认罪，可以不处死他。此时正好又碰上水西宣慰安疆臣替其父亲安国亨请求举行抚恤典礼，兵部尚书石星写下手札出示给安疆臣，要他到杨应龙那里催促杨应龙到官府认罪，便可赦免杨应龙的罪行。安疆臣便带着手札前往播州招抚杨应龙。此时，七姓大族害怕杨应龙出去后得以赦免罪行，因为四方的亡命之徒都逃窜、藏匿在该地区，倚仗杨应龙的反叛从中取利，因此，对朝廷官府过往的驿卒和文书，总是设置障碍阻拦。邢。。便传文给重庆知府王士琦，让他到綦江催促杨应龙到安稳听候审讯。杨应龙派其弟弟杨兆龙到安稳，建好馆舍，储备好干粮，到郊外叩头迎接王士琦，按礼仪隆重地向他敬献猪牛羊等礼物，并说：“杨应龙已将下面的罪魁祸首绑缚起来，在松坎等待判罪。杨应龙之所以不敢到安稳来，就是害怕坠入安稳的仇人所设下的无法预测的灾祸之中。请求阁下到松坎去接受杨应龙的认罪。”王士琦说“：松坎以往也是上奏勘查之地。”便一个人骑马前往。杨应龙果然双手反绑着立于道旁，见到王士琦后哭着请求免己死罪，情愿帮朝廷收执其他罪人，献上罚金，让自己享受安国亨的境遇。安国亨，也是以往遭到攻讦，因对自己的罪行感到害怕而不出自己的地界的人，所以杨应龙引用他的例子来比照自己。王士琦为此向邢。。请示，邢。。答应了杨应龙，杨应龙便将黄元等十二人绑缚起来献给官府。官府验明以后，将黄元等人抵杨应龙的死罪，判杨应龙输送四万金子帮助采伐树木以赎自己的罪，革去杨应龙的官职，让他的儿子杨朝栋代理他的职务，他的次子杨可栋留在官府追赎其父的罪行，黄元等人在重庆闹市被斩首，总督将此事处理结果上报朝廷。此时倭寇还没有消灭干净，兵部想对杨应龙缓一手以专事东方的倭寇；朝廷也因为杨应龙以往积有功劳，就同意了总督的处理结果，在松坎设置同知来治理该地，任命王士琦为川东兵备副使，负责弹压、治理该地区的事务。
杨应龙获宽大处理后，对所犯的罪行更不思悔改。不久，杨可栋在重庆去世，杨应龙就更加痛恨官府。他敦促官府将其儿子的尸体送回来归葬，没有结果。官府传文书给他，要他交完赎罪的金钱，他大言不惭地说：“我的儿子能活过来，银子就送到。”他带兵驱赶一千多僧人替他儿子招魂；分别派遣土目据守关隘。他还以优厚待遇招抚各地苗人，将苗人中的健壮者称为硬手；播州百姓中家底稍殷厚些的，财产都被他没收以供养苗族人。苗族人全都愿意出死力为他效劳。
二十四年(1596)，杨应龙带兵残害了余庆，抢劫了大阡、都坝地区，对草塘、余庆二个司和兴隆、都匀各卫所实行焚烧抢劫，还派其同党包围黄平，杀戮了重安长官全家，其势又大为旺盛。二十五年，流动抢劫了江津和南川，兵临合江索讨他的仇人袁子升，将袁子升用绳缒到城墙下车裂而死。此时，兵备王士琦被调派去征讨倭寇，杨应龙便统领苗兵大肆劫掠贵州洪头、高坪、新村等屯。之后，又侵犯湖广的四十八个屯，阻塞驿站交通。他还刺探原先上奏要求惩罚他的仇人宋世臣和罗承恩的下落，知道他们带着家属隐藏在偏桥卫，便攻破该地，在城中大肆搜索，杀戮他们的父母，奸淫他们的妻子女儿，其行为非常悲惨残酷。
二十七年(1599)，贵州巡抚江东之命令都司杨国柱带领三千士兵进剿杨应龙，争夺三百落。贼人假装败北，将官军诱入三百落全部歼灭，杨国柱等人全部战死。江东之为此被罢官，以郭子章代理江东之的职务，起用李化龙节制四川、湖广、贵州等地的军事，调拨东征的刘纟廷、麻贵、陈瞞、董一元等将领南征。此时杨应龙乘大军还未集结，带兵进犯綦江。綦江城内新招募的士兵还不满三千人，贼兵八万人掩杀过来时，游击张良贤带兵与杨应龙展开巷战，结果战死，綦江陷落。杨应龙尽杀城中百姓，把尸体投入江中后把江面都盖满了，江水也全被血水染红。杨应龙还勾结九股地区没有汉化的苗人和黑脚苗人协助自己，屯兵官坝，声称要伺机进攻四川。不久，他又带人焚烧了东坡、烂桥、湖南、贵州等地的路标。
二十八年(1600)，杨应龙率兵五路齐发，攻破龙泉司。此时总督李化龙已移驻到重庆，所征调的军队也已集结，便在二月十二日誓师，分八路进军。这八路军队中，每一路约有三万人，其中朝廷所调拨的官兵占三成，土司地区征调的土兵占七成，旗鼓甲仗森严壁垒而列，苗人大为惊慌。总兵刘纟廷攻破其前锋，杨朝栋只身逃脱，贼人为此丧胆落魄。于是官军便连续攻克桑木、乌江、河渡三个关隘，夺取了天都、三百落等地的粮囤。贼人遭受连续失败后，乘间隙突然进犯乌江，诈称官军在水西的陇澄会师，诱骗永顺的土兵进入该地后，突然斩断桥梁，淹死将士无数。不久刘纟廷攻破九盘，进入娄山关。娄山关是贼人的前门，关上万峰耸天，中间只有一条小路可通。刘纟廷从山间小道上攀藤而上，破除栅栏，攻陷了娄山关。四月初一，官军屯驻在白石，杨应龙率领各地苗兵与官军决一死战。刘纟廷亲自勒马冲击杨应龙的中坚苗兵，又派兵从两翼夹击，将杨应龙打败，追击到养马城，又连续攻破龙爪、海云等险要的村屯，直逼海龙囤。这些都是贼人所倚仗的天险，所谓飞鸟和猿猴都过不去的地方。此时，偏、沅两地的官军已攻破青蛇囤，安疆臣也夺取了落氵蒙关，到达大水田，焚烧了桃溪庄。贼人见形势危急，父子相互抱头痛哭，上囤死守并给每路官军递投降书，以缓官军进兵的速度。总兵吴广进入崖门关，扎营在水牛塘，与贼人力战三天，打退了敌人。贼人施诡计，让一个女人在囤上拜表痛哭，边哭边说“：田氏向官军投降。”又诈称杨应龙已仰头喝药而死，将此报告给吴广。吴广轻信此言，按兵不动。不久，吴广发现了贼人的诈计，用兵猛攻，焚烧了二个关隘，夺取了贼人砍柴汲水的道路。八路大军集结到海龙囤，筑起了长长的包围圈，轮番向贼人发动攻击，贼人知道此次必死无疑。碰上李化龙的父亲新近逝世，皇帝下诏让他在军中带孝作战。李化龙认为贼人所居的前囤地势太险无法逾越，命令马孔英率领劲兵猛攻后囤。天气老是下雨，将士们在泥淖中苦战。六月四日，天气忽然晴朗，刘纟廷身先士卒，攻克土城。杨应龙感觉更加紧迫，散发金子招募死士为他抗拒官军，没人响应。杨应龙起身，提着刀到堡垒上巡视，看见四面火光冲天，大批官军已登上囤，攻破土城杀了进来。杨应龙便仓皇地同二个爱妾一起在室内自缢，并引火自焚。吴广抓获了杨应龙的儿子杨朝栋，急忙寻找到杨应龙的尸体，冲出火焰。贼人的叛乱终于平息。
从出师到消灭贼人历时一百一十四天，八路大军共斩敌人首级二万多个，活捉杨朝栋等一百多人。李化龙将此大捷公开上报，将俘虏献到朝廷，用锉磋磨杨应龙的尸体，将杨朝栋、杨兆龙等人在闹市车裂。播州从唐朝归入杨氏，传了二十九代，达八百多年之久，到杨应龙手上终于灭亡。
三十一年(1603)，播州残余的逆贼吴洪、卢文秀等人又发生叛乱，总兵李应祥等人带兵讨伐平定了他们。朝廷于是便将播州一分为二：属四川的部分称为遵义府；属贵州的这一部分称为平越府。
永宁，唐朝时称为蔺州。宋朝时，该地在泸州的江安、合江二个县的境内。元朝时，此地设置了永宁路，统领了筠连州和腾川县，后来此地又改为永宁宣抚司。
明朝洪武四年(1371)平定了四川，永宁归附朝廷，朝廷在此设置永宁卫。六年，筠连州滕大寨的蛮人编张等发动叛乱，伪称自己是云南的官军，占领了湖南长宁各州县，朝廷命成都卫指挥袁洪前去讨伐。袁洪带兵到叙州的庆符县，攻破了清平关，活捉了他们自封的千户李文质等人。编张逃走后，又带兵进犯江安各县。袁洪带兵追击，又打败了他们，焚烧了他们九个寨子，俘获编张的儿子、自封的镇抚张寿。编张逃跑后藏匿在溪洞里，他的余党散入云南。皇帝听到报告以后，赐谕给袁洪说：“南方的蛮族人时而叛乱时而又归顺没有一定的准则，对他们不足以加罪。既然已经抓获了俘虏，就将这些俘虏编入军队之中，驻扎在边境之上。对待他们就是要以军队震慑，使他们对我天朝的威风有所畏惧，这样就不会留下后患。”不久，编张又聚众占领了滕大寨，袁洪带兵讨伐并打败了他们，追到小芒部时，编张逃跑了，于是攻取了得花寨，活捉了阿普等人。从此以后，编张再也不敢出来了，他们的寨子也都被扫平。于是朝廷便把筠连州降为县，让其隶属于叙州，将九姓长官司隶属于永宁安抚司。
七年(1374)朝廷将永宁等处军民安抚司升为宣抚使司，官秩为正三品。八年，朝廷任命禄照为宣抚使。十七年，永宁宣抚使禄照向朝廷献贡马，皇帝下诏赏赐给他钱钞、冠和衣服，规定他们每三年向朝廷入贡一次。十八年，禄照派他的弟弟阿居来朝觐皇帝，说近年来应该交纳的赋马都已交纳了，只有粮食无法如数完成。原因是大军向南征讨，蛮族百姓惊慌逃窜，无法按时耕种，加上打仗以后疾病瘟疫流行，死亡的人很多，所以来不及收缴和运送粮食。皇帝下令蠲免。二十三年，永宁宣抚上奏说，他所管辖的地盘内有水道一百九十滩，其中的江门大滩有八十一处，石头都将水流堵塞了。皇帝下诏书，命令景川侯曹震前去开凿疏通。二十四年，曹震到泸州巡察，看到有支流通往永宁，便凿去石头、削平崖壁、疏通河道以通漕运。
二十六年(1393)，禄照的儿子阿聂继承其父的职务。此前，禄照因犯法被逮到京城，在他向朝廷申述清楚后回去时，死在途中。这时禄照的儿子阿聂和弟弟阿智都在太学里学习，于是朝廷便让阿聂的庶母奢尾掌管宣抚使司的事务。到二十六年时奢尾进京朝觐，请求朝廷让阿聂继承其父的职务，皇帝同意了。永乐四年(1406)，朝廷免除了永宁荒田的租赋。
宣德八年(1433)，已故宣抚阿聂的妻子奢苏进京朝觐献贡物。九年，宣抚奢苏上奏说“：我们这里学习儒学的学生都是当地的僚族人，朝廷所教授的官话他们听不通，因此难以训诲他们。永宁的监生李源资质厚道学识贯通，请求朝廷比照云南鹤庆府的例子，授予他儒学训导。”皇帝下诏同意这个建议。景泰二年(1451)，朝廷同意了布政司的请求，减免了永宁宣抚司的税课和部分钱钞，因该地苗族人悄悄作乱，客商不通，路途阻绝的缘故。
成化元年(1465)，山都掌、大坝等寨子的蛮族贼人分别抢劫了江安等县，兵部将此事上报朝廷。二年，国子监学录黄明善上奏“：四川山都掌的蛮族贼人每年都出没无常，杀害掠夺良民。景泰元年(1450)招抚了他们，不久又叛乱。天顺六年(1462)招抚他们后又造反。近来总兵李安命令永宁宣抚奢贵赴大坝招抚他们，也没有效果。恐怕开战已不可避免，所以应该及早集结大军，早点决定计划，不使边关酿成祸患。”三年，黄明善又上奏“：宋朝时多刚县的蛮族入侵，朝廷派白刀艹子兵就将他们平息了。白刀艹子，就是今天的民壮人；多刚县，就是今天的都掌多刚寨。前朝使用乡兵有明显效果，所以我们也应紧急招募民壮人，让他们协助官军。都掌的水稻十月份就成熟，应带兵在此之前将其水田里的稻禾抢收过来，这样蛮族人三个月之内必然没有粮吃。这时官军可以分成三路进剿：南路从金鹅池向大坝攻击；中路从戎县向箐前进攻；北路从高县向都掌进攻。一旦小寨被攻破了，其大寨自然就被攻拔了。大坝往南一百多里远的地方是芒部，往西南二百里远的地方是乌蒙，命令这二个府的土官截住险要之地。再用火器自下而上顺风放火焚烧，这样蛮族人的寨子一定可以攻克。当然征调土兵必须处置妥当，招募民壮人也必须赏罚分明讲究信义。”皇帝下诏让总兵官参用这条建议。此时总督尚书程信也上奏“：都掌的地势险要，一定要有土兵当向导才行。请求皇上谕告东川、芒部、乌蒙、乌撒各府的土兵，并急速调拨湖广的永顺、保靖的军队，让他们准备随时出征。”之后，又请求从南京调战马一千匹应用。皇帝都同意了这些请求。四年，程信上奏说“：永宁宣抚奢贵开通了运道，擒住了贼人的首领，皇上应降印有皇帝玺印的诏书奖励他。”皇帝同意。
十六年(1480)，白罗罗的羿子与都掌大坝的蛮族互相攻击，礼部侍郎周洪谟说“：我是叙州人，了解叙州蛮族的情况。戎、珙、筠连、高各县在前朝都是土官统治，只有在我明朝才开始以流官代替土官前来治理。流官与蛮族人之间言语不通、性情不一，造成激变。洪武、永乐、宣德、正统四代皇帝命令将士四出征讨，蛮族人的叛乱更加滋蔓，至今还顽固不化。我以前曾经说过从长远考虑，在这些地区应仍设立土官来治理。都御史汪浩侥幸获得边功，欺骗杀害了官府保护的土官和寨主二百多人，各地蛮族人对他怨入骨髓，转而大肆劫掠。等尚书程信统领大军才能克服他们。我认为现今不如顺从蛮族人的情况，挑选出他们公推信服的人做大寨主，让他世袭官职管理当地蛮族群众，这样才能相互平安。”他又说：“白罗罗，相传是广西的流动的蛮族人，有数千人之多，没有人统属他们。景泰中年，他们纠集了戎县、珙县的苗族人，攻破了长宁等九个县，现今又侵扰都掌。他们居住的地方，崖险箐深，很难将他们剪除消灭。对他们也应该设立长官司来治理。他们的居住地，靠近芒部，应隶属于芒部。羿子，归永宁宣抚所管辖。永宁是云南、贵州的要冲之地，南跨赤水、毕节六七百里，让一个柔弱的女人来节制数万强梁之徒，所以每每有大肆抢劫行为。我认为宣抚司中的土著僚人，仍然归宣抚奢贵治理，而其南部各寨靠近赤水、毕节等要道的蛮族人，应设立二个长官司来管理，这二个长官司仍隶属于永宁宣抚。土官有职务而无官俸，对国库没有损害，对边防反而有益。”皇帝同意他的这些建议。嘉靖二十五年(1546)，永宁宣抚司女土官奢禄向朝廷进献大木，皇帝按惯例给予封赠。
万历元年(1573)，四川的巡抚曾省吾上奏朝廷：“都掌的蛮族叛逆，调拨军队前往征讨时，土官奢效忠首先在调拨之列。但奢效忠与贵州的土官安国亨有仇，请求朝廷一并下令给总兵官刘显节制他们，使他们不能找借口复仇。”皇帝同意。当初之时，乌撒与永宁、乌蒙、水西、沾益各土官的辖地边境相连，他们之间又世代有亲戚，亲情很厚。不久安国亨杀死安信，安信的兄长安智勾结永宁宣抚奢效忠报仇，彼此相互攻杀。安国亨手下的吏目与安智有亲戚关系，怕被安国亨斩杀，就投奔安路墨。安路墨冒充土知府安承祖，赶赴京城代奢效忠向朝廷上奏。不久安国亨也派他儿子安民向朝廷陈述事情的经过，安国亨与奢效忠都奉命听从四川、贵州巡抚的审核。四川、贵州巡抚审核后建议依照蛮族人的习俗罚牛赎罪，皇帝认为可行。奢效忠死后，他的妻子世统没有儿子，他的妾世续有一个幼小的儿子名叫崇周。世统认为自己是嫡妻，想夺取官印，便与世续互相仇杀。此事正向朝廷奏报期间，总兵郭成、参将马呈文利用他们的权力，突然发兵千余人，深入到落红。奢氏家族传了九代的积蓄，被搜刮抢劫一空。世续也派兵尾随郭成等人之后进入落红。奢效忠的弟弟奢沙卜出来抗拒，并邀集水西的土兵前来报仇。郭成的军队打了败仗，便向世统下檄文，要她去抓奢沙卜。世统不答应，郭成便又杀了三个把总，聚集苗兵一万多人，想进攻永宁以泄怨气。巡按官弹劾郭成为谋利挑起事端，应遭逮捕；并建议朝廷给奢效忠的妻妾二人授予冠带，将奢效忠原有的领地分开，由她们各管自己所属的部分，宣抚司的官印暂时封存，等奢崇周长大成人，赴京继承官职处理事务时才交付给他。皇帝认为此议可行。十四年，奢崇周代理其父的官职，不久死亡。
奢崇明，是奢效忠的亲弟弟奢尽忠的儿子。他从小是个孤儿，世统抚养了他一十三年。至此，将他送到永宁，世续送给他毡和马，并答应将宣抚司的官印交给他。本来事情已这样安排定了，不料阎宗传等诸位奸人认为以前自己跟随世续驱逐世统，杀死了奢沙卜，害怕奢崇明即位后，报以前的仇恨，于是依附于水西，拥立阿利以保护自己。安疆臣对他们两派阳奉阴违，纵容蛮族土兵四出焚烧抢劫屯堡，官兵都无法禁止他们。总督将此事上报朝廷，朝廷讨论后任命奢崇明暂时管理宣抚司事务，希望奢崇明能减少夙恨，广收人心。此时阎宗传等人依然如故地攻掠永宁、普市、摩尼等地。奢崇明承袭宣抚使职务近一年了，世续竟然还不把官印交给他，却私下交给安疆臣的妻弟阿利。巡抚派都司张神武将世续抓起来索讨官印，世续说官印在镇雄的陇澄那里。
陇澄，就是水西的安尧臣。陇氏家族快要绝种时，安尧臣入赘到陇家，于是冒称自己姓陇，叫陇澄。前文所叙述的讨平播州、叙州的功劳中，陇澄也参与在内，而中央官员根本就不知道他是安尧臣。安尧臣在外依仗自己在播州所立的功劳，在内依靠水西的势力，有占据镇雄节制永宁的野心。四川的抚按官以安尧臣不是陇氏的血脉，不授予他镇雄陇氏家族世袭的官职。安尧臣因此心怀两端，暗地里帮助世续。他的意图是世续将永宁的官职授予阿利，则自己所占据的镇雄会更加牢固；况且朝廷现在厌兵不愿动武，阎宗传、阿利等人又刚开始骚乱，自己完全可以躺着取代陇氏。而阎宗传等人每次焚烧掠夺，都称自己是镇雄的军队，以此吓唬各部落。川南道梅园楼所俘获的蛮族人丑者说，镇雄府派遣将领鲁大功率五个营的军队屯驻在大坝，水西的兵也渡过马铃堡，相互约定进攻永宁，普市的人于是全都溃散，阎宗传等人因这是一座空城便弃之而去。奢崇明又说，安尧臣所派的目把彭月政、鲁仲贤等人率六大营军队帮助叛逆之贼，声称将抵达叙南，进攻永宁和泸州。于是，总兵侯国弼等人，都把罪恶归咎于安尧臣。都司张神武等人所抓的俘虏唤者、朗者，都是镇雄府的土目，安尧臣也无法辩解。
贵州的抚按官以西南地区多兵事，军粮都已用完为由，无意进取镇雄府。安尧臣因此就把普市、摩尼等地的焚烧掠夺，都归到四川将领的头上。朝廷中也有议论，认为四川的将领有贪功而挑起事端的罪行。四川巡抚乔璧星上奏说“：安尧臣很狡猾，老谋深算，想篡夺镇雄府的大权，垂涎蔺州已有年头了。阎宗传之所以敢背叛朝廷就是倚仗镇雄府的势力，就好像镇雄倚仗水西一样。水西的安疆臣没有出兵助逆，我已探明了他们的情况，所以应乘叛贼恶势力还未形成，命令贵州抚按官与我一起会合，前去进剿。倘若安尧臣仍像以前一样酝酿作恶，我即带兵前去击碎他，不让小虫变成蛇，不使堵塞了的裂缝变成河。”这疏章上奏皇帝后，朝廷大臣讨论中竟然没有人敢决定对安尧臣用兵。时间长了以后，阿利死了，官印也交出来了，四川官员中想驱逐安尧臣的想法，最终还是没结果。此时播州清疆的议论正热烈，贵州、四川各地也搞得纷纷扬扬。到此，永宁该不该用兵的讨论就像聚在一起诉讼一样。此时，朝廷已经一心一意想休兵。三十五年(1607)，皇帝下令释放奢世续，赦免阎宗传等人的罪行，寻访陇氏的子孙来继承镇雄府的官职。并命令安疆臣约束安尧臣，把安尧臣带回本土司，听令遥授职务官衔，不许他假冒姓氏继承陇氏的职务。这样，阎宗传便投降朝廷，安尧臣也请求避到本土司去，贵州的总督于是便请求撤回军队。
按旧制度，永宁卫隶属于贵州，而其中的土司又隶属于四川。自从水西与蔺州相互攻击后，军民激变。奢崇明虽然继承了永宁的官职，但官员的审核并未上报朝廷。摩尼、普市的千户张大策等人又请求朝廷将永宁宣抚改为流官。兵部认为，无缘无故地改由流官统治，将把奢崇明置于何地？便命令有关官员迅速完结以前审核的诸案。于是四川巡抚拟定张大策犯有失守城池罪，应当斩首；贵州巡抚则拟定张神武犯有擅自动兵抢劫掠夺罪，也应当斩首。张大策，是贵州人，张神武，是四川人。因此两省都替本省的人打抱不平，各位大臣自己互相诉讼，纷纷扬扬解决不下来。此时又碰上奢崇明的儿子奢寅与水西已故土官的妻子奢社辉争夺领地，奢社辉所带领的安家的兵马数量十倍于奢寅的兵马，但奢寅的兵马很精锐，所以双方互相争持着。四川、贵州的抚按官无法节制他们，就将此状况上报朝廷。四十八年(1620)，贵州巡抚张鹤鸣认为赤水卫白撒所的屯地被永宁军队占据，应清理出来归还赤水卫。这些都有待于朝廷派官员审核后才能决定。
天启元年(1621)，奢崇明请求调拨骑兵和步兵二万人前去支援辽阳，皇帝同意了。奢崇明与其儿子奢寅长久以来蓄有异志，借调拨军队支援辽阳的机会，派遣女婿樊龙和部下同党张彤等人，带兵到达重庆后长期驻扎着不出发。巡抚徐可求亲自赶到重庆催促永宁军队赶快出发，樊龙等人以增加行粮为名乘机造反，杀死了巡抚、道官、府官、总兵等官员二十多人，占领了重庆。他们还分兵攻打合江、纳溪，攻破泸州，攻陷遵义，兴文的知县张振德战死。兴文，是以前九丝蛮的地方。他们又进军包围成都，号称自己的政权为大梁。布政使朱燮元、周著，按察使林宰等在成都城内分门固守。石石主土司的女土官秦良玉派其弟秦民屏、侄子秦翼明等发兵四千，日夜兼程，悄悄地渡过重庆，在南坪关扎营。秦良玉自己统率精兵六千沿江而上直奔成都。其他的援兵也渐渐集结起来。此时奢寅攻城很急，暗地里接纳刘勋等人做内应。事情被发觉后，刘勋等人被诛杀。奢寅等又造云梯和旱船，昼夜攻城。城中也以炮石还击他们。双方相持一百天，碰到贼军将领罗乾象派人向官军投诚，表示愿意杀死贼人为自己赎罪。这天晚上，罗乾象纵火焚烧军营，贼兵大乱，奢崇明父子仓惶出逃，丢弃的钱帛谷米堆得像山一样，穷苦的百姓靠此得以活命。罗乾象便率其同党胡汝高等人前来投降。此时朝廷已授予朱燮元巡抚职务，他率四川的士兵追击奢崇明，江安、新都、遵义等郡邑都收复过来了。这时是天启二年(1622)三月。樊龙将余部数万人收集起来，占据了重庆的天险和要塞。朱燮元督促秦良玉等人夺取二郎关，总兵杜文焕攻破了佛图关，诸将领将军队围着重庆驻扎下来。奢寅派贼人同党周鼎等分道来救援，周鼎被官军打败后逃走，结果被合江的百姓绑缚起来。官军与平茶、酉阳、石石主三个土司的土兵合围重庆，重庆城中缺粮。朱燮元便设计活捉了樊龙，将他杀了；张彤也被乱军所杀；生擒了樊龙的儿子樊友邦及其同党张国用、石永高等三十多人，收复了重庆。
此时安邦彦在贵州造反，奢崇明与他遥相声援。三年(1623)，四川的官军收复遵义，进攻永宁，在土地坎与奢寅相遇，双方率兵进行搏战。官军奋勇出击，叛军被打败，奢寅受伤后逃走，樊虎也战死了。官军进军攻克永宁城，降服了二万贼人。官军又进军攻拔了红崖、天台各囤寨，投降的人每天都有。奢崇明的势力越来越小，便向水西求救，安邦彦派十六个营的军队过河前来支援他。罗乾象攻破了蔺州，焚烧了九凤楼，他的老巢覆灭了。奢崇明踉踉跄跄地逃走了，投奔到水西。安邦彦与奢崇明合兵一处后，分别侵犯遵义和永宁。四川的官军在芝麻塘将他们打败，他们便逃进了青山。各位将领逼近渭河，在龙场与奢崇明激战，俘获了奢崇明的妻子安氏和奢崇辉等人，斩杀的人数以万计。蔺州平定了，总督朱燮元向朝廷请求以赤水河为界，河东的龙场隶属于贵州，河西的赤水、永宁隶属于四川。在永宁设置了道和府，与遵义、建武声势相联。
不久，贵州巡抚王三善遭安邦彦的袭击而死，奢崇明的势力又有扩张，过了春天将大举进攻永宁。此时正好奢寅被其部下所杀，朱燮元亦因父亲亡故离开军队去奔丧了，奢崇明、安邦彦得以苟延残喘。奢崇明自称为大梁王，安邦彦号称自己为四裔大长老，其下称元帅者不可胜数。他们合兵十多万人，规划先进犯赤水。崇祯初年，朝廷起用朱燮元来总督贵州、湖广、云南、四川、广西等地的事务，会师讨伐。朱燮元定下计谋诱使贼人向永宁深入，然后在五峰山的桃经坝邀击他们，再命令总兵侯良柱率军大败他们，奢崇明、安邦彦都被俘斩首。这一仗，扫荡了四川、贵州几十年来都没有去除的大恶贼，这是朱燮元的功劳。
酉阳，汉朝时是武陵郡的酉阳县。宋朝时，此地为酉阳州。元朝时隶属于怀德府。
明朝洪武五年(1372)，酉阳军宣慰司的冉如彪派其弟弟冉如喜前来进觐献贡，朝廷便设置了酉阳州，任冉如彪为知州。八年，酉阳州改为宣抚司，仍让冉如彪担任宣抚使。其下设置平茶、邑梅、麻兔、石耶四个洞的长官司，任命杨底纲、杨金奉、冉德原、杨隆为长官司长官，让他们每三年入京城献贡物一次。石耶洞长官不能亲自到京城来，朝廷便命令他将贡物附在酉阳宣慰司一起带来。二十七年，平茶洞长官司长官杨再胜，阴谋杀害兄长的儿子杨正贤和洞长杨通保等人。杨正贤等人觉察后逃到京城，向朝廷诉说此事，并称杨再胜与景川侯一起阴谋造反。皇帝命令将杨再胜逮捕审讯，杨再胜服罪，按法律此罪应诛杀九族，因此杨正贤也应治罪。皇帝诛杀了杨再胜，释放了杨正贤，让他继承了长官司长官职务。酉阳宣抚冉兴邦也因承袭了官职前来京城朝觐，皇帝便命令将酉阳宣抚司改为隶属于谕州。
永乐三年(1405)，指挥丁能、杜福招抚了亚坚等十一个寨子里的没有汉化的苗族人共一百三十六户，告诉他们各派遣儿子入京城朝觐皇帝，皇帝命令他们隶属于酉阳宣抚司管辖。四年朝廷免除了酉阳荒田的租税。五年，冉兴邦派遣部落酋长龚俊等人向朝廷贡献土产，并感谢皇上允许在当地设立儒学的恩典。
景泰七年(1456)，朝廷调拔宣抚佥事冉廷璋的军队，去征讨五开、铜鼓等地叛乱的苗族人，皇帝赐谕给他们奖赏。天顺十三年，皇帝命令给宣抚冉云进散官一阶，因为他帮助讨伐叛乱的苗族人和擒捉石全州有功劳。
弘治七年(1494)，宣抚冉舜臣因在征讨贵州叛乱的苗人中立有功劳，请求朝廷提升他的职务。兵部认为没有提升土司职务的惯例，请求朝廷给冉舜臣的官阶进到明威将军，赐谕褒奖他。十二年，冉舜臣上奏说宋农寨的蛮族贼人纠集起来，胁迫各寨洞的蛮人去烧杀抢劫，请求朝廷派兵进剿搜捕。保靖、永顺二个宣慰也上奏说邑梅的副长官杨胜刚父子阴谋占领酉阳，勾结俊信洞的洞长杨广震等人，号召宋农、后溪等地的蛮族人聚兵烧杀抢劫，请求朝廷派兵一并讨伐。兵部商议后认为酉阳各溪洞之间相互联络，容易煽动作乱，应立即将其扑灭，请各地的镇巡官相机行事。十四年朝廷调拨酉阳的军队五千人协助官军进剿贵州的女贼人米鲁。
正德三年(1508)，酉阳宣抚司的护印舍人冉廷玺和邑梅长官司上奏，说湖广的镇溪所洞的苗人聚众攻掠抢劫，请求朝廷派兵进剿搜捕。八年，宣抚冉元向朝廷进大木二十根，请求朝廷免去其儿子冉维翰继承官职时须赴京城朝觐的任务，皇帝同意了。二十年，冉元又向朝廷进献大木二十根，皇帝下诏按情况赏赐给他一定颜色的衣服。
万历十七年(1589)，宣抚冉维屏向朝廷献大木二十根，价值超过三千。工部讨论，认为应给冉维屏加赏从三品的衣服，以劝勉土官向朝廷献忠诚，皇帝同意了。四十六年，朝廷调拨酉阳兵四千人，命令宣抚冉跃龙带领着去支援辽阳。四十七年，冉跃龙派遣儿子冉天胤及冉文光等带兵赶赴辽阳，驻扎在虎皮、黄山等地达三年，解除了敌人对奉集的包围。他们又援救沈阳，因在浑河失利，冉见龙战死，同时阵亡的还有一千多人。他们撤回军队守卫辽阳时，又被已投降的敌人放火焚烧，冉文焕等人战死，同时死亡的还有七百多人。兵部尚书张鹤鸣说：“冉跃龙派遣子弟不远万里前来保卫朝廷，冉见龙已以身殉国，冉跃龙又自己捐献二千金黄金，运送军用器械到山海关，帮助军队摆脱困境，招回和振奋了军魂军威，其对朝廷确实忠义可嘉。我在贵州时，冉跃龙也自己捐献粮饷主动征讨叛乱的红苗人，屡次建立奇功。现今他在边关地区又以忠节于朝廷而著称，朝廷应对他优加抚恤，以感化各边关的土著人。”
天启元年(1621)，朝廷授予冉跃龙宣慰使的职务，其妻舒氏也被授予诰命。还抚恤了阵亡将士家庭一千七百多家。二年，奢崇明叛乱，冉跃龙率军前去支援官军，与官军一起包围了重庆。在诛杀奢崇明的战斗中，他手下的土舍冉绍文也参加了并立有功劳。四年，冉跃龙因奉朝廷调遣前往别处效命，便向朝廷请求优抚他的弟弟冉见龙和各阵亡将士的家庭，皇帝命令将该请求交有关机构办理。
崇祯九年(1636)，宣慰使冉天麟上疏朝廷“：作恶的冉天胤，假传圣旨阴谋夺取我的官爵和土地，没有成功，便擅自带兵残杀。”朝廷将该奏章交给抚按官去调查审核。此时四川正为盗贼所困扰，各位大官自顾尚不暇，对土官的事便多束之高阁了。